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引起小儿便秘的原因较多，主要有以下几点：
1.饮食不足：小儿进食太少时，经过消化后肠道中余渣少，大便减少;奶中糖量不足使大便干燥;较长时间的饮食不足，致营养不良使腹肌、肠肌瘦弱，张力不足、蠕动无力，导致顽固性便秘。
2.食物成分不适宜：便秘与食物的成分关系密切，进食成分中如蛋白质过量而碳水化合物不足，使肠发酵菌相对减少影响发酵使大便呈碱性、干燥致便秘。如食物中含大量酪蛋白，粪便中含多量不能溶解的钙皂致粪便增多，容易便秘。另外精米粉，精面粉较全谷类中渣滓过少易于便秘。
3.肠道功能失常：由于生活和排便不规律，排便反射形成减弱或不形成，肠肌松弛而便秘。某些能使肠壁肌力减弱，功能失常的药物或疾病以及交感神经功能不正常均可致便秘。
4.遗传与生理缺陷：某些患儿生后即便秘。有家族史，可能与遗传有关，某些生理缺陷性疾病如肛门裂、肛门狭窄、先天性巨结肠等均可引起便秘。
5.精神因素：突然的精神刺激、生活环境的改变等可致短时便秘。
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