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1.肝脏病变：HCV，HBV感染发展成慢性活动性肝炎，慢性迁延性肝炎(50%)，肝硬化(10%-20%)，肝癌发生率高于一般人群30倍。肝功能衰竭已成为血友病患者死亡的不可忽视的原因之一。HCV治疗同非血友病患者的肝炎，α干扰素及病毒唑合用，约1/2获得长期缓解。国外对少数失代偿性肝硬化血友病患者进行肝移植，移植的肝脏产生一定的FVIII或FIX，因此血友病同时得到改善。少数患者HCV合并HIV感染，治疗棘手，死亡率大大增加。
2.获得性免疫缺陷病(AIDS)：1978-1985年，90%重型HA感染HIV，AIDS成为血友病死亡的主要原因(占65%)。HIV感染引起继发性免疫缺陷，卡波氏瘤增加200倍，非霍奇金淋巴瘤增加29倍。1985年以来，随着严格献血员筛选，病毒检测及病毒灭活技术(加热法，有机溶剂加表面活性剂，亲和层析法，二步法病毒灭活)的不断改进，现已基本消除感染HIV的危险，血制品的安全性与有效性得到大大提高。治疗同其它非血友病AIDS患者。
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