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2、质量标准和付款标准的关系
在处理支付问题时，容易将质量标准和付款标准二者栓在一起或划上等号，认为对质量不合格的工程扣款是理所当然的事情。这也是人们常说的“一票否决制”。例如，有人认为：
①混凝土构件上出现了裂缝尚未修补，就不能对其进行支付；
②作为单价合同的支付，就应该严格与质量标准对照，低于标准的就不应付款；
③实验结果没有出来之前，也不应付款；
④工程师尚未检查，不同意支付；
⑤承包商尚未退交支付支持材料，拒绝支付。
事实上，质量标准和付款标准是两个不直接相关的概念。如果二者直接相关，FIDIC合同中风险的平衡关系就会改变。因为在FIDIC合同下，支付并不意味着对完成的工程进行批准，这也是FIDIC合同规定了中期支付机制的原因。
FIDIC合同的公正性之一体现在它要求承包商为其所做的工作得到支付，以保证其现金流。同时规定了保留金扣除、履约保函以及其他保险措施，保证承包商按照质量规范进行施工，以保证业主得到一个满意的工程。
例如，在某工程中，承包商就这类问题提出了签证不足的争议，并提交争议审查机构审理，结果业主方不但支付了扣压的本金，还付出了一大笔利息。
根据该项目国际咨询专家和争议审查机构的建议，处理和质量有关的支付问题应注意下述事项：
（1）工程师在签发证书时必须公平合理，如果一个项目中的整个工程没有全部被拒绝，那么扣除100％的申请金额是不合理的。
（2）工程师不能扣减全部的申请金额，除非工程师已发出明确的指令该工程必须全部拆除和重做，否则扣减只适用于需要拆除和重做的那部分工程。
（3）对有缺陷的工程，工程师可以进行合理的扣减，但要给出明确的解释。工程师应明确需要承包商采取的对缺陷进行修复的措施。当承包商的修复工作达到了工程师满意后，应支付所扣的金额。
　　3、承包商的施工方法
一般合同中规定永久工程或临时工程开工之前的一段合理时间内，承包商应提交施工方法（或施工组织设计）供工程师批准。对承包商施工方法进行检查是不必要的，这仅是人们常说的“人、机、料、法、环”五环控制中的一环。
在某工程中，承包商在争议审查机构的一次现场考察中抱怨工程师不断要求承包商提交施工方法说明或报告，承包商提交了100多个施工方法说明，却从未收到工程师的批复。工程师要求提交无关的细节，不能对一些限制性因素适当地予以澄清，也不能很好地说明他们的观点，从而不必要地延误了对施工方法的批准。
事实上，在FIDIC合同下，保证其施工方法的完备性是承包商的主要风险之一，因此合同中一般不会对施工方法说明的详细程度作出限制。如果在工程师的苛刻要求下通过了一种施工方法，而实践又证明这种方法不可行，就可能造成索赔。对于施工方法，工程师应关心的是人员安全、工程的长期安全和施工过程人员安全的影响。如果工程师的不正当要求导致施工计划的延误，或工程师实质上改变了承包商提出的施工方法，承包商肯定会提出索赔。
4、分包商
关于分包商，工程师往往希望知道分包商和承包商之间的合同和相关细节，要求承包商提交分包合同等资料。实际上，工程师没有任何必要知道承包商和分包商之间合同的条款和条件。工程师一般仅仅需要对分包商的资质、分包项目和分包金额情况进行审查。工程师也没有必要对承包商和分包商的关系进行干扰，任何干扰都容易导致合同问题的出现和造成承包商的索赔机会。
在施工现场，监理工程师对分包商或承包商工人的直接指挥或干扰也会带来合同问题

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